Odjel za sudsku upravu odgovoran je za nadgledanje prijema, procesuiranje, arhiviranje i distribuciju dokumenata, predmeta i svih sudskih spisa Odjela I i Odjela II (uključujući spise predmeta, dokazne materijale dostavljene u postupku i arhivu) te njihovo čuvanje, osiguravajući integritet i sigurnost podataka. Takođe je odgovoran za rasporede suđenja i planiranje korištenja sudnica, pripremu zapisnika sa suđenja i snimanje sudskih procesa (transkripti i video zapisi).

Odjel za sudsku upravu upravlja sistemom automatske dodjele predmeta za cjelokupno Krivično odjeljenje. Odjel koordinira korištenje tehničkih kapaciteta u sudnicama kako bi se osiguralo efikasno i nesmetano vođenje sudskih postupaka uključujući i kapacitete za simultano prevođenje suđenja na tri zvanična jezika u BiH i engleski jezik. Također priprema i rukovodi statističkim podacima o radu Suda te izrađuje izvještaje o radu Suda.